Una cosa es el protocolo de aplicación y otra la topología de la red... No tienen nada que ver...
Haciendo referencia a las capas del modelo OSI y a modo de ejemplo, tendríamos por ejemplo los siguientes protocolos:
Nivel Físico: RS232, Coaxial, Fibra óptica, RadioFrecuencia, un tio montado en un burro etc...
Nivel de Enlace: Ethernet o 802.3, Wifi o 802.11, PPP, etc...
Nivel de Red: ARP, IP, X.25, ICMP, NetBEUI, etc...
Nivel de Transporte: TCP, UDP, etc...
Nivel de Sesión: SSL, NetBios, RPC, etc...
Nivel de Presentación: PSAP, SSAP, (Paso a través, o dicho de otra forma: "pillo la info, no hago nada y se la doy al siguiente nivel"), etc...
Nivel de Aplicación: HTTP, FTP, POP3, SMTP, IRC, ICQ, Telnet, etc...
En una comunicación de un sistema distribuido, al menos deben existir los 3 primeros (son OBLIGATORIOS y sin ellos no habría comunicación). Los 4 siguientes serán optativos y dependerá del uso final.
La topología de la red (local, internet, etc.), hace referencia a los 3 primeros niveles, y la comunicación es cosa suya... De forma que al programador de la aplicación le da igual que la info vaya por una fibra óptica, o que vaya un tio en un burro para llevar y traer la info. La tarea de decidir a quién, cómo y cuando la llevan a cabo la tarjeta de red del equipo (nivel de enlace) y el router (nivel de red).
En tu caso, seguramente habrás ido directamente a la capa Aplicación y habrás usado el protocolo correspondiente (o en otro caso, te habrás improvisado uno basandote en tu arquitectura cliente/servidor)... También puedes que hayas metido (o usado implícitamente, si has usado clases ya implementadas), protocolos a nivel de transporte (normalmente TCP).
Con todo esto quiero decir que, si usas por ejemplo el protocolo HTTP, o FTP, o ICQ O etc..., en tu aplicación, da igual que el servidor esté en China y el tio en su burro tenga que llevar y traer la info desde y hasta el cliente, como que el servidor esté en la habitación o sala de al lado y sea un cablecito CAT-5, o incluso en tu propia máquina local. El protocolo de aplicación es independiente de la arquitectura de la red y de su topología.
Por tanto, si lo único que has implementado es la aplicación, habrás tenido que hacer uso de algún protocolo de aplicación, y a ese protocolo le da igual lo que haya por debajo (presentación, sesión, transporte, red, enlace y físico) y de cómo se las apañen para llevar y traer la información al destinatario...
Por tanto apostaría a que es más un problema de configuración de tu router/firewall (Nivel de red).
Un saludo.
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