SOLUCIONADO
Parece ser que todo el jaleo que he tenido es debido a algo llamado apparmor, que si no es modificado provoca que no se pueda acceder a la carpeta donde se guarda la base de datos
al final me he deshecho de los symlinks o enlaces simbolicos y he cambiado el datadir.
pongo el enlace del post que he encontrado y seguro y espero les sirva a muchos como me ha servido a mi:
http://beyondterminal.tumblr.com/post/18785093709/howto-modificar-el-datadir-de-mysql
y por si el post desapareciese y para que quede aqui la respuesta, lo pongo en esta linea:
editamos este archivo
# sudo gedit /etc/apparmor.d/usr.sbin.mysqld
y cambiamos solo las dos lineas que son donde estaba la base de datos anteriormente, y escribimos la ruta de donde estan ahora
despues reiniciar el pc
Marcadores