Es un proyecto muy interesante...

En cuanto al microcontrolador, yo obtaría por un PIC como el 16f873, porque ya integran uart y todo y solo tienes que combertir las señales en señales que acepte el PC (-12V y +12V), para lo que hay un integrado que vale unos 50centimos y con 4 o 5 condensadores listo.

Si necesitas ayuda con la parte del código que se ejecute en el PC avisa. Y si decides obtar por usar un PIC, aunque hace ya unos 7 u 8 años que no los toco, malo será que no me acuerde de algo.

Un Saludo