Base de datos MySql de Oscommerce

Muy buenas a toda esta peña del foro!
Mis dudas son las siguientes: Tengo un portal web creado con phpnuke y una tienda virtual en desarrollo creada con la ultima version de Oscommerce 2.2. La base de datos que queremos utilizar es la que viene con Oscommerce, llamada MySql independiente a la de phpnuke.

Tenemos la base de datos en el servidor con todas las tablas, campos, relaciones... y lo que queremos hacer, es pasar todas las tablas, campos y registros a la base de datos mysql, la base de datos mysql viene con las tablas creadas y relacionadas, y algunas se asemejan con nuestras tablas por ello no queremos tocarlas, simplemente queremos añadir nuestros registros, la otra forma mas bestia seria meter manualmente todos los registros, pero eso nos llevaria meses hacerlo.

Pos eso, gracias de antemano y a ver si me podeis ayudar un pokito.

Saludos